单细胞测序

可提供从单细胞水平对mRNA、染色质区域、CNV、免疫组库的研究,解决组织样本无法获得不同细胞间异质性信息或样本量太少无法测序的难题。

10x Genomics单细胞转录组测序

利用油包水的微反应体系,通过序列标签区别群体中的不同细胞,获得单细胞水平的数字化基因表达谱,实现数千甚至数万个单细胞群体分析。

10x Genomics单细胞ATAC-Seq

在单细胞水平对细胞染色质开放区域进行研究,绘制细胞染色质开放区的单细胞图谱,是单细胞水平研究表观遗传学的有效手段。

10x Genomics单细胞免疫组库测序

实现在单细胞水平同时实现免疫组库分析(TCR和BCR)和5’端基因表达谱分析,为免疫组学研究提供更具扩展性的平台。

10x Genomics单细胞CNV

不但能够实现在单细胞DNA水平检测CNV和罕见克隆,而且能很好地解决群体平均化所带来的问题,为揭示基因组异质性、理解克隆进化提供了可扩展的解决方案。

10x Genomics Visium空间转录组

将基因空间表达可视化,在识别不同细胞群的同时保留空间背景,提供了关于组织微环境中细胞功能、表型和位置关系的关键信息。

文章案例

单细胞转录表达谱分析揭示4个hiPSC亚群

10x Genomics Single Cell RNA-Seq鉴定18787个人类诱导多能干细胞的不同起始亚群

转录表达谱是发现调控未分化状态关键基因和基因网络的中心。由于细胞间基因表达具有高度异质性,单细胞RNA测序(scRNA-seq)可以用来加深人们对个体多能细胞功能的理解。研究人员通过10x 单细胞转录组测序研究了18787个人WTC CRISPRi 人诱导多能干细胞,确定了为每个亚群定义的新基因和其通路,并且开发了一个多基因预测模型对单细胞进行精确亚群分类。这为扩展对多能细胞复杂性的理解提供了一个基准单细胞数据集。

参考文献:Quan et al., Single-cell RNA-seq of human induced pluripotent stem cells reveals cellular heterogeneity and cell state transitions between subpopulation. Genomic Research, 2018.